IA pomáhá vědcům vytvořit trojrozměrné modely buněk, molekul či virů
23. 5. 2024

S tím, jak se to dělá, se v polovině května přijelo seznámit patnáct mladých vědců z České republiky a okolních zemí na třídenní workshop, pořádaný Biologickým centrem Akademie věd ČR v Českých Budějovicích. Biologická elektronová mikroskopie umožňuje nahlédnout do neviditelného světa mikroskopických organismů, které nás obklopují, umožňuje nám studovat ultrastrukturu buněk, tkání bakterií, virů a podobně. výsledné mikroskopické snímky těchto trojrozměrných objektů jsou však dvojrozměrné, což nesnadňuje jejich interpretaci a vede ke ztrátě informací.
„Velký pokrok v přípravě preparátů, v záznamové technice av počítačovém zpracování snímků, který se objevil v posledních letech, přinesl nové možnosti vytvořit ze série dvourozměrných snímků trojrozměrné modely pozorovaných objektů. A to už je jen krok k využití umělé inteligence při analýze těchto modelů, hledání, počítání a měření buněčných organel, makromolekulárních komplexů nebo virů v buněčné ultrastruktuře, což nám pomáhá řadu fyziologických procesů, které na buněčné úrovni probíhají,“ vysvětluje Jana Nebesářová z Laboratoře elektronové mikroskopie Biologického centra AV ČR, která workshop uspořádala.
Účastníci workshopu se vyzkoušeli se zabudovanými softwarovými nástroji AI a prakticky na připravených souborech pod vedením softwarových expertů Ilyi Beleviche u University v Helsinkách a Juliena Roussela a Jana Giesebrechta z firmy Thermo Fischer Scientific z Berlína. Workshop se konal v rámci aktivity Pokročilé 3D zobrazování biologických preparátů pomocí nízkonapěťové elektronické mikroskopie výzkumného programu Strategie AV21 Průlomové technologie budoucnosti – senzorika, digitalizace, umělá inteligence a kvantové technologie.
(hyš-tz)
redakce@prirodatv.cz
Foto: Biologické centrum AV ČR